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清華錢班學(xué)生兩度轉(zhuǎn)行:從入門到一作發(fā)Science只用2年 明年回國做PI

導(dǎo)讀 兩度轉(zhuǎn)行之后,95后貴州小伙以一作身份,在Science發(fā)表了第一篇文章。而這距他剛?cè)腴T,也才不過兩年時間。他叫做胡脊梁,曾以物理競賽保送

兩度“轉(zhuǎn)行”之后,95后貴州小伙以一作身份,在Science發(fā)表了第一篇文章。

而這距他剛?cè)腴T,也才不過兩年時間。

他叫做胡脊梁,曾以物理競賽保送到清華錢學(xué)森力學(xué)班(“錢”班),隨后在大二那年跟隨興趣所向。

在聽了施一公講座之后,他決定轉(zhuǎn)至細(xì)胞動力學(xué),一個物理和生物交叉研究領(lǐng)域。

中國科學(xué)院院士鄭泉水曾對他印象深刻,

為了完成一篇論文,他一年時間學(xué)了20門研究生的課程。這個學(xué)生在“錢班”成績一般,但是他用論文一樣可以證明自己。

本科畢業(yè)、直博,而在一切看似順風(fēng)順?biāo)H,他又突然換方向,轉(zhuǎn)碩再讀博,研究更加復(fù)雜多樣的生態(tài)動力學(xué)。

△圖源:中國科學(xué)報

入門2年一作發(fā)Science

不妨就以他最新的Science論文成果,來介紹他的研究領(lǐng)域。

一言以蔽之,這篇文章在解決“是什么導(dǎo)致生態(tài)系統(tǒng)不穩(wěn)定?”的問題。

事實上這個問題由來已久,過去許多科學(xué)家都在致力于破譯其中所有的影響因素。

這其中較為著名的兩個預(yù)測因素為,群落中物種的數(shù)量以及物種之間的相互作用。

然而這放在現(xiàn)實自然系統(tǒng)中卻很難得到驗證,即便可以觀察物種之間的相互作用,通常也無法完成控制實驗。

而胡脊梁所在的團(tuán)隊,解決這個問題的途徑是:物理學(xué)。

為生態(tài)系統(tǒng)創(chuàng)建一個“相圖”,最終驗證需要結(jié)合著兩個參數(shù):物種數(shù)量和種間相互作用強(qiáng)度整合一起,成功預(yù)測生態(tài)群落穩(wěn)定與否的情況。

具體而言,他們在實驗室合成了2到48種細(xì)菌的生態(tài)系統(tǒng),監(jiān)測群落在生長、分散和稀釋周期中群落的組成和生物量。

此外他們發(fā)現(xiàn),成對共生的概率隨著補充的葡萄糖和尿素濃度的增加而降低。這意味著,通過增加營養(yǎng)物質(zhì)的方式,可以用來加強(qiáng)物種之間的相互作用。

實驗結(jié)果顯示,群落生物量的波動在物種規(guī)?;蛘呦嗷プ饔脧?qiáng)度增加下,也會同樣增加。以48個物種群落為例,研究人員發(fā)現(xiàn)只有在低營養(yǎng)濃度下才會達(dá)到穩(wěn)定。

最后他們還繪制了“相圖”,描述生態(tài)系統(tǒng)如何僅基于兩個因素發(fā)生變化。類似于物理中基于溫度和壓力,來描述水的狀態(tài)變化。

結(jié)果顯示,相同條件下,波動的群落比穩(wěn)定的群落更加多樣化。

通訊作者、胡脊梁的導(dǎo)師Jeff Gore表示,相圖的驚人之處在于它可以以非常簡單的形式總結(jié)大量信息,找出一個邊界來預(yù)測穩(wěn)定性的喪失以及波動的開始。

據(jù)中國科學(xué)報報道,這是學(xué)者第一次對復(fù)雜生態(tài)系統(tǒng)提出一個比較統(tǒng)一的框架——

僅靠兩個變量,不依賴于任何生物學(xué)細(xì)節(jié),就可以描述任何一個生態(tài)群落。

據(jù)胡脊梁本人介紹說,這篇論文投出后,返回的審稿意見有50多頁,但三個審稿人都給出了高度評價,“心里就有了底,感覺自己這項工作的意義得到了認(rèn)可”。

MIT官方消息,這種相圖的創(chuàng)建,可以幫助生態(tài)學(xué)家在信息很少的情況下,對森林等自然生態(tài)系統(tǒng)中可能發(fā)生的情況做出預(yù)測。

MIT直博轉(zhuǎn)碩再讀博

胡脊梁現(xiàn)在在MIT從事生態(tài)動力學(xué)領(lǐng)域研究。Science上發(fā)表的這篇論文,是他從單細(xì)胞力學(xué)轉(zhuǎn)方向后,發(fā)表的第一篇文章。

是的沒錯,2年前,MIT直博的胡脊梁,研究領(lǐng)域還是單細(xì)胞力學(xué)。

博士三年級那年,發(fā)生了什么?

時間回到2017年。那時候,胡脊梁從清華畢業(yè),以直博生身份進(jìn)入MIT,并延續(xù)了本科階段研究細(xì)胞動力學(xué)的路線。

鄭泉水接受采訪時曾回憶,博一時,胡脊梁的思維和鉆研勁頭讓MIT導(dǎo)師們格外留意。為此,物理系專門開展了一個研討會,討論主題是:胡脊梁這樣的學(xué)生是怎么培養(yǎng)出來的?

進(jìn)入MIT后,胡脊梁于2019年和2021年先后發(fā)出兩篇PNAS(《美國科學(xué)院院報》)。

然而,“改變方向”這四個字卻在他心中扎根。

胡脊梁自身慣有的學(xué)習(xí)思維偏“工程式”,更喜歡簡潔有邏輯,能夠從復(fù)雜現(xiàn)象抽象出優(yōu)美模型或理論的東西。

因此,他長期認(rèn)為生物學(xué)的書不太優(yōu)美,存在許多冗余信息。

直到他接觸了生物物理學(xué):原來生物學(xué)也可以用簡潔的語言去描述。

于是,直博第三年,胡脊梁選擇“轉(zhuǎn)行”,一頭扎進(jìn)生態(tài)動力學(xué)的河流。

這其中不僅有其自身思維方式和研究范式的原因,他現(xiàn)在的導(dǎo)師、也是Science所發(fā)表論文的通訊作者,Jeff Gore,提供了巨大幫助。

△Jeff Gore

Jeff是MIT物理學(xué)教授,研究方向正是生物物理學(xué)。

他所在的戈爾生物物理實驗室,研究興趣是利用微生物種群,探索種群或群落內(nèi)部的相互作用是如何導(dǎo)致豐富突發(fā)現(xiàn)象的。

幾番接觸下來,胡脊梁發(fā)現(xiàn)Jeff和他思考問題的方式和興趣方向非常契合,他深覺,如果進(jìn)入Jeff的選題組,一定是一種“享受”。

胡脊梁主動找到 Jeff,表明自己想轉(zhuǎn)到他的課題組讀博的強(qiáng)烈意向。

在完全能夠直博畢業(yè)的情況下,胡脊梁先轉(zhuǎn)為碩士畢業(yè),改投Jeff門下。

如愿以償,胡脊梁進(jìn)入Jeff的“Physics of Living System Center”課題組攻讀博士學(xué)位。

“我現(xiàn)在在研究復(fù)雜微生物群落的動力學(xué),這些菌群廣泛存在于人體腸道、皮膚以及植物的根系和土壤。”胡脊梁介紹道,“不同種類的細(xì)菌有物種間的相互作用,物種和環(huán)境之間也有相互作用,就形成了一個完整的生態(tài)系統(tǒng)。”

在接受《中國科學(xué)報》采訪時,胡脊梁將這次轉(zhuǎn)換方向稱為“可能是在MIT讀博期間做得最正確的一個選擇”。

吸引眾多導(dǎo)師的清華錢班學(xué)生

在不同領(lǐng)域取得不錯的成果,除了MIT的5年研究經(jīng)驗,還歸功于本科時,胡脊梁在清華大學(xué)“錢班”夯實了基礎(chǔ)。

何謂錢班?

2009年,為嘗試回答“錢學(xué)森之問”,清華大學(xué)成立了“清華學(xué)堂人才培養(yǎng)計劃”錢學(xué)森力學(xué)班(以下簡稱錢班),每年招收本科生30名。

(錢學(xué)森之問的內(nèi)容:為什么我們的學(xué)??偸桥囵B(yǎng)不出杰出人才?)

2013年,就讀于貴陽市第一中學(xué)的胡脊梁,以理科653分參加錢班全國創(chuàng)新挑戰(zhàn)賽,獲全國第一名,并獲得清華學(xué)堂計劃獎學(xué)金。

在錢班,胡脊梁遇到了另一個讓他獲益匪淺的老師,清華錢班首席教授、中科院院士鄭泉水。

△鄭泉水

本科期間,胡脊梁因產(chǎn)生了一個稚嫩的idea,在寒風(fēng)中與鄭泉水交談了兩個多小時。

盡管這個課題最后也沒有做出什么結(jié)果,但鄭老師當(dāng)時還是像對待一個博士生一樣尊重我的想法,并培養(yǎng)我。

在鄭泉水身上,胡脊梁學(xué)得最多的,就是一個科學(xué)家擁有的思考問題的過程。

彼時,在鄭泉水的努力下,錢班先后將SURF(Senior Undergraduate Research Fellowship,高年級學(xué)生研究員)、SRT(Student Research Training,本科生科研訓(xùn)練)納入必修環(huán)節(jié)。

后來,錢班還開設(shè)8個學(xué)分的ORIC(Open Research for Innovation Challenge,開放挑戰(zhàn)性創(chuàng)新研究),學(xué)生需用1年左右的時間,獨立負(fù)責(zé)一個完整的科研項目。

胡脊梁就讀大一那一年,正是錢班以研究學(xué)習(xí)為目的的“進(jìn)階史研究學(xué)習(xí)系統(tǒng)”開始完整運行的第二年。他的ORIC在北京大學(xué)定量生物學(xué)中心完成。

進(jìn)階式研究學(xué)習(xí)系統(tǒng)給胡脊梁留下的印象,是“一個非常有效的科研培養(yǎng)模式”:

錢班充分尊重每名學(xué)生的興趣和特長的同時,完成基礎(chǔ)科研能力訓(xùn)練。

鄭泉水老師他們不是讓大家在同一個維度比高低、形成惡劣競爭。

也是大一那一年,胡脊梁就表現(xiàn)出了對細(xì)胞膜的好奇,滿懷著憧憬,胡脊梁開始實驗、觀察、建理論模型。

為此,他自學(xué)20門研究生課程,主動聯(lián)系生物系、化學(xué)系及北大生物學(xué)院的實驗室。

受他的熱情吸引,僅清華生命科學(xué)學(xué)院,就有16位教授來給錢班上課;MIT物理系、材料系、計算機(jī)系、機(jī)械系等院系的6位教授也加入錢班,開設(shè)了挑戰(zhàn)性問題課程。

因為興趣的天平傾斜,大二時,胡脊梁進(jìn)行了第一次方向轉(zhuǎn)變。

那時候,胡脊梁聽完西湖大學(xué)校長、中國科學(xué)院院士施一公的講座,更覺21世紀(jì)是生物的時代,隨即嘗試往這方面發(fā)展。

△施一公

據(jù)他本人描述,他大概是第一個從錢班轉(zhuǎn)去做生物的。出乎他意料,鄭泉水表示了大力支持。

鄭泉水不僅拎出來兩、三個小時專門給他講交叉研究,還把他推薦給了清華生命科學(xué)學(xué)院教授俞立。

亟待探索生命科學(xué)世界的胡脊梁,更是主動找到力學(xué)與生物學(xué)幾何方向的實驗室,開啟了物理生物交叉研究的篇章。

俞立對待胡脊梁這名本科生,和對待別的博士生并無二致。

和博士生同樣的預(yù)算、和博士生一樣使用課題組經(jīng)費,不同之處在于,偶爾還有小灶——補生命科學(xué)研究的課程。

“這些老師給了我很大的信心和動力。”至今,他還和鄭泉水、俞立兩位老師保持聯(lián)系,在MIT的直博轉(zhuǎn)碩再讀博,也得到了兩位老師的支持和鼓勵。

總而言之,錢班在胡脊梁的學(xué)習(xí)生涯中雕刻下濃墨重彩的一筆。

回顧錢班就讀生涯,胡脊梁的成績并不算出類拔萃,但他用論文證明了自己的能力。

本科期間,胡脊梁共發(fā)表5篇論文,其中1篇還是以共同一作身份,發(fā)表在PNAS上。

(所以他一共發(fā)了3篇PNAS)

One More Thing

胡脊梁日后的規(guī)劃現(xiàn)在已經(jīng)明了:

據(jù)中國科學(xué)報消息,在結(jié)束MIT的博士后研究后,他將于回國繼續(xù)從事科研,做個PI(Principle Investigator,學(xué)科研究員)。最終實現(xiàn)“有一天能夠把生物書寫得像物理書一樣簡潔而優(yōu)美”。

他說,現(xiàn)在的導(dǎo)師Jeff給他的另一個啟發(fā)是,以后自己做PI時,也要讓大伙兒開開心心做科研,有自己的風(fēng)格,也有一定的自由度。

“人在心情好的時候,才有創(chuàng)造。”

論文鏈接:

https://www.science.org/doi/10.1126/science.abm7841

參考鏈接:

[1]https://news.mit.edu/2022/ecosystems-instability-models-1006

[2]http://cpp.cau.edu.cn/art/2021/10/29/art_21981_793837.html

[3]https://www.tsinghua.edu.cn/info/1179/17390.htm

[4]http://www.jyb.cn/rmtzgjyb/201908/t20190816_253478.html

[5]https://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/10/488065.shtm

文章來源:快科技

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